Ryo Saeba es el mejor "City Hunter" de la ciudad y toma casos junto a su compañera Kaori. Una modelo llamada Ai Shindo ha sido atacada y lo contrata para que sea su guardaespaldas. Shinji Mikuni, el presidente de una empresa de tecnología que ha contratado a Ai para su campaña publicitaria, resulta ser un viejo amigo de Kaori, y ellos se involucran. Mientras tanto, mercenarios se están reuniendo en Shinjuku... y un importante traficante de armas llega a Japón con una nueva arma, pero con Mikuni en la historia, Ryo y Kaori se están distanciando.
