El mundo se está muriendo, ya no puede sostener la vida. La familia Ainsworth puede usar el Santo Grial para salvar a la humanidad, pero el precio de la salvación es el sacrificio de la chica mágica Miyu. Sin embargo, el hermano de Miyu, Shirou, no permitirá que se la lleven sin luchar. Ahora, depende de Illya intervenir y encontrar una solución que salve no solo a Miyu, sino a todo el mundo de una inminente condena. Pero cuando el precio por la salvación del mundo es la vida de una sola chica inocente, ¿qué elegirá Illya?
