En un mundo habitado por personas de apenas unos centímetros de altura, las jóvenes Hakumei y Mikochi viven juntas en una casa construida en un árbol. Hakumei es una carpintera enérgica y tomboy, mientras que Mikochi es una costurera femenina y tranquila. A pesar de sus diferencias, se llevan bien y pasan sus días divirtiéndose mientras viven en el bosque.
Las dos pasan su tiempo trabajando, saliendo a aventuras turísticas y haciendo compras en el Mercado Tsumiki junto al océano. Hacen muchos amigos en el camino, ya sean criaturas del bosque sensibles como Iwashi, la comadreja, o personas en miniatura como la cantante Konju y el inventor Sen.
Hakumei to Mikochi es una mirada relajante a la vida diaria de sus personajes principales mientras exploran e interactúan con su pequeño mundo que parece salido de un cuento de hadas.
