Percibidos como extraños y temidos por los humanos, con el tiempo los deformados llegaron a ser conocidos como Mushi. Aunque no albergan intenciones malignas hacia los humanos, muchos sufren las consecuencias de su existencia y su extraña naturaleza; explotar a los Mushi sin entenderlos, incluso involuntariamente, puede llevar al desastre y al conflicto para cualquier persona involucrada. Mushishi Zoku Shou continúa la historia de Mushishi Ginko en su viaje para ayudar al mundo visible a coexistir con los Mushi.
Durante sus viajes, Ginko descubre a varios individuos dotados—aquellos malditos por la circunstancia y aquellos que mantienen una frágil simbiosis con los Mushi—enfrentándose inevitablemente a la pregunta de si la humanidad, tanto talentosa como torturada, puede gestionar la responsabilidad de lo no visto. Además, como Mushishi, Ginko debe aprender más sobre estos extraños seres y decidir si tiene el derecho de interferir en las complejas relaciones entre los Mushi y la humanidad.
