Forzados a abandonar su planeta natal, Cybertron, debido a la amenaza de un agujero negro, Optimus Prime se prepara para guiar a sus guerreros Autobots hacia la Tierra. Justo cuando están a punto de partir, los Autobots se enfrentan a Vector Prime, quien les advierte sobre la amenaza a la galaxia si las cuatro Llaves Cyber Planet no se reúnen a ti…
Han pasado 10 años desde la fatídica batalla contra Unicron. Muchos de los Decepticons que lucharon en la batalla contra Unicron se han unido a los Autobots para extraer Energon, una fuente de energía alternativa. Pero una nueva fuente de mal ha surgido: Alpha Q, que planea robar el Energon de los Autobots con la ayuda de Scorponok y los Terrorcon…
En el planeta mecánico de Cybertron viven superorganismos robóticos conocidos como Transformers. Allí, principalmente compuestos por convoyes, el ejército de Cybertron y su viejo enemigo Destron se enfrentaron en un conflicto por obtener un nuevo poder que se uniera a su lado. Se trataba de una nueva raza de Transformers conocida como los Micrones…