Bendecido con ojos capaces de percibir a los youkai que son, de otro modo, invisibles, Takashi Natsume esconde su habilidad de su nueva familia y amigos para proteger la pacífica vida diaria de todos. Sin embargo, Natsume nunca deja de mostrar la misma bondad hacia los benevolentes youkai y felizmente les devuelve sus nombres usando el infame Libro de Amigos que heredó de su difunta abuela, Reiko.
Mientras tanto, el clan exorcista Matoba todavía desea que Natsume se una a sus filas debido a su abrumador don. Sin embargo, Natsume rechaza firmemente la invitación del clan, ya que no todos los exorcistas son tan razonables como su amigo Shuuichi Natori, y muchos sellan de manera inapropiada e indiscriminada a cada youkai que se interpone en su camino. Insatisfecho con la respuesta de Natsume, Seiji Matoba lo chantajea para que asista a una gran reunión de poderosas familias exorcistas. Natsume pronto se encuentra en compañía de personas peligrosas y youkai por igual. Pero incluso entonces, continúa desafiando los métodos severos de los exorcistas y cree que la paz entre ambos mundos es posible.
