Una crisis se aproxima a la Tierra con la expansión de un agujero negro en movimiento, en el año 2220. Se elabora un plan para trasladar a más de 300 millones de personas de la Tierra. Cuando la última flota de transporte es atacada, el Acorazado Espacial Yamato viene a su defensa; el barco ahora es comandado por Susumu Kodai, quien tiene a su hija Miyuki a bordo, hija de Susumu y Yuki.
